Table 3. The number of SNPs, means (± SD) of minor allele frequency (MAF), the observed heterozygosity (OHE) and the polymorphic information content (PIC) by chromosome

Chr. No. SNPs MAF OHE PIC
1 4,552 0.23 ± 0.14 0.32 ± 0.15 0.26 ± 0.11
2 2,744 0.23 ± 0.14 0.31 ± 0.16 0.25 ± 0.11
3 2,045 0.23 ± 0.15 0.32 ± 0.16 0.25 ± 0.11
4 2,657 0.25 ± 0.16 0.33 ± 0.16 0.26 ± 0.11
5 1,756 0.22 ± 0.14 0.31 ± 0.16 0.25 ± 0.11
6 2,582 0.26 ± 0.15 0.35 ± 0.15 0.27 ± 0.11
7 2,535 0.25 ± 0.15 0.34 ± 0.16 0.26 ± 0.11
8 2,156 0.27 ± 0.15 0.36 ± 0.16 0.28 ± 0.11
9 2,575 0.23 ± 0.15 0.32 ± 0.16 0.25 ± 0.11
10 1,426 0.22 ± 0.15 0.31 ± 0.17 0.24 ± 0.12
11 1,271 0.22 ± 0.15 0.31 ± 0.17 0.24 ± 0.12
12 1,184 0.24 ± 0.15 0.33 ± 0.16 0.26 ± 0.11
13 3,186 0.24 ± 0.15 0.33 ± 0.16 0.26 ± 0.11
14 3,095 0.23 ± 0.15 0.33 ± 0.16 0.25 ± 0.11
15 2,201 0.20 ± 0.15 0.28 ± 0.17 0.22 ± 0.12
16 1,378 0.23 ± 0.14 0.33 ± 0.15 0.26 ± 0.11
17 1,314 0.23 ± 0.14 0.32 ± 0.15 0.25 ± 0.10
18 946 0.25 ± 0.15 0.34 ± 0.15 0.27 ± 0.11
Overal 39,603 0.24 ± 0.15 0.32 ± 0.16 0.26 ± 0.11
SNP, single nucleotide polymorphism.